Proses pengolahan garam setelah desalinasi air laut mungkin mempunyai dampak tertentu terhadap lingkungan sekitar. Misalnya, proses pembuangan garam dapat mempengaruhi keseimbangan ekosistem laut dan memberikan dampak tertentu terhadap organisme dan tumbuhan di wilayah laut sekitarnya. Oleh karena itu, pabrik desalinasi air laut perlu mengambil tindakan yang tepat untuk mengurangi dampak emisi garam terhadap lingkungan.