Desain sistem pengolahan air hemodialisis sangat kompleks dan memerlukan beberapa tahap pemurnian untuk memastikan bahwa kualitas air memenuhi standar. Langkah-langkah utamanya meliputi prapengolahan air baku, pengolahan RO, penyimpanan dan penyaluran air murni, serta pemantauan dan pengendalian akhir.